Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhoP15409 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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RhoP15409 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RhoP15409 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RhoP15409 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RhoP15409 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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