Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NclP09405 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NclP09405 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NclP09405 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NclP09405 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NclP09405 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NclP09405 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NclP09405 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NclP09405 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms