Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms