Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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