Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhoP15409 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhoP15409 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhoP15409 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhoP15409 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms