Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a4Q9Z306 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a4Q9Z306 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a4Q9Z306 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a4Q9Z306 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a4Q9Z306 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a4Q9Z306 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a4Q9Z306 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc22a4Q9Z306 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a4Q9Z306 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a4Q9Z306 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms