Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsc22d3Q9Z2S7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms