Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C8

Ybx2, Y-box-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx2Q9Z2C8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx2Q9Z2C8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ybx2Q9Z2C8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ybx2Q9Z2C8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx2Q9Z2C8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms