Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mtmr1Q9Z2C4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mtmr1Q9Z2C4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mtmr1Q9Z2C4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mtmr1Q9Z2C4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr1Q9Z2C4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr1Q9Z2C4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mtmr1Q9Z2C4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms