Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Nup160Q9Z0W3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Nup160Q9Z0W3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Nup160Q9Z0W3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Nup160Q9Z0W3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Nup160Q9Z0W3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Nup160Q9Z0W3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Nup160Q9Z0W3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Nup160Q9Z0W3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Nup160Q9Z0W3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Nup160Q9Z0W3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Nup160Q9Z0W3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Nup160Q9Z0W3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Nup160Q9Z0W3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms