Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F6

Rad9a, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad9aQ9Z0F6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad9aQ9Z0F6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad9aQ9Z0F6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad9aQ9Z0F6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad9aQ9Z0F6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad9aQ9Z0F6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms