Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrknQ9WVS6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PrknQ9WVS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrknQ9WVS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms