Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cited4Q9WUL8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cited4Q9WUL8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cited4Q9WUL8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cited4Q9WUL8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms