Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx9Q9WUH2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx9Q9WUH2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx9Q9WUH2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms