Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc6Q9R1S7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc6Q9R1S7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc6Q9R1S7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc6Q9R1S7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc6Q9R1S7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc6Q9R1S7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Abcc6Q9R1S7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abcc6Q9R1S7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc6Q9R1S7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc6Q9R1S7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Abcc6Q9R1S7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc6Q9R1S7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms