Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmed2Q9R0Q3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmed2Q9R0Q3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed2Q9R0Q3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms