Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcm1Q9R0L6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcm1Q9R0L6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcm1Q9R0L6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms