Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas3Q9QZQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Npas3Q9QZQ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npas3Q9QZQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms