Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms