Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh11Q9QYF1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh11Q9QYF1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh11Q9QYF1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms