Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan3Q9QY33 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan3Q9QY33 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tspan3Q9QY33 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan3Q9QY33 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 391.2 ms