Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP7

C1qtnf1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf1Q9QXP7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1qtnf1Q9QXP7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1qtnf1Q9QXP7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1qtnf1Q9QXP7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1qtnf1Q9QXP7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1qtnf1Q9QXP7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms