Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Homer2Q9QWW1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer2Q9QWW1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer2Q9QWW1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Homer2Q9QWW1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms