Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chaf1aQ9QWF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chaf1aQ9QWF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chaf1aQ9QWF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chaf1aQ9QWF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chaf1aQ9QWF0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms