Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl3Q9JMG7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdgfl3Q9JMG7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms