Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nova1Q9JKN6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nova1Q9JKN6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nova1Q9JKN6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nova1Q9JKN6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms