Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF4

Clec6a, C-type lectin domain family 6 member A, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec6aQ9JKF4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clec6aQ9JKF4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec6aQ9JKF4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec6aQ9JKF4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec6aQ9JKF4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms