Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alyref2Q9JJW6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alyref2Q9JJW6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms