Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gfra4Q9JJT2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra4Q9JJT2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gfra4Q9JJT2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gfra4Q9JJT2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gfra4Q9JJT2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms