Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI81

Cts8, Cathepsin 8, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts8Q9JI81 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cts8Q9JI81 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cts8Q9JI81 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cts8Q9JI81 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cts8Q9JI81 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cts8Q9JI81 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cts8Q9JI81 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cts8Q9JI81 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms