Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OtofQ9ESF1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OtofQ9ESF1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
OtofQ9ESF1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OtofQ9ESF1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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