Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Erg28Q9ERY9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Erg28Q9ERY9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Erg28Q9ERY9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Erg28Q9ERY9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms