Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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