Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc38a3Q9DCP2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a3Q9DCP2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a3Q9DCP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc38a3Q9DCP2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc38a3Q9DCP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a3Q9DCP2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.3 ms