Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1ip1Q9DCE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1ip1Q9DCE5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pak1ip1Q9DCE5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pak1ip1Q9DCE5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pak1ip1Q9DCE5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pak1ip1Q9DCE5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pak1ip1Q9DCE5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pak1ip1Q9DCE5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pak1ip1Q9DCE5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms