Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubiad1Q9DC60 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubiad1Q9DC60 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ubiad1Q9DC60 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubiad1Q9DC60 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubiad1Q9DC60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubiad1Q9DC60 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubiad1Q9DC60 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubiad1Q9DC60 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubiad1Q9DC60 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ubiad1Q9DC60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms