Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAM1

Lrrc34, Leucine-rich repeat-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc34Q9DAM1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc34Q9DAM1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc34Q9DAM1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc34Q9DAM1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc34Q9DAM1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc34Q9DAM1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc34Q9DAM1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc34Q9DAM1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc34Q9DAM1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms