Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph3bQ9DA80 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3bQ9DA80 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Rsph3bQ9DA80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms