Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smco2Q9DA21 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smco2Q9DA21 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smco2Q9DA21 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smco2Q9DA21 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms