Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmco5aQ9D9D5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco5aQ9D9D5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5aQ9D9D5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms