Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700109H08RikQ9D9C0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700109H08RikQ9D9C0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700109H08RikQ9D9C0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms