Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf2Q9D8U4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qtnf2Q9D8U4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qtnf2Q9D8U4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms