Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl17Q9D8P4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl17Q9D8P4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl17Q9D8P4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mrpl17Q9D8P4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms