Protein–RNA interactions for Protein: Q9D875

2010109A12Rik, MCG1041431, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109A12RikQ9D875 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010109A12RikQ9D875 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2010109A12RikQ9D875 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
2010109A12RikQ9D875 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2010109A12RikQ9D875 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
2010109A12RikQ9D875 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms