Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnbd2Q9D5U8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnbd2Q9D5U8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnbd2Q9D5U8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnbd2Q9D5U8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms