Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20lQ9D4V6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tomm20lQ9D4V6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tomm20lQ9D4V6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tomm20lQ9D4V6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tomm20lQ9D4V6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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