Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf6Q9D4J7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf6Q9D4J7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf6Q9D4J7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf6Q9D4J7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf6Q9D4J7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms