Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D454 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D454 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D454 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D454 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D454 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D454 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D454 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D454 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D454 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D454 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D454 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D454 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D454 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D454 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D454 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D454 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D454 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D454 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D454 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D454 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D454 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D454 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D454 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D454 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D454 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D454 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D454 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D454 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D454 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D454 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D454 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D454 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D454 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D454 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D454 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D454 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D454 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D454 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D454 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D454 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D454 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D454 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D454 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D454 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D454 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D454 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D454 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D454 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D454 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D454 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D454 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D454 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D454 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D454 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D454 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D454 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D454 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D454 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D454 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9D454 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9D454 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D454 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D454 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D454 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D454 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D454 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9D454 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9D454 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D454 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D454 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D454 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D454 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D454 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D454 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D454 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D454 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D454 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D454 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D454 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D454 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D454 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D454 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D454 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D454 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D454 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D454 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D454 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D454 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D454 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D454 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D454 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D454 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D454 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D454 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D454 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D454 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D454 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D454 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D454 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms