Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam227aQ9D3V8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam227aQ9D3V8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227aQ9D3V8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam227aQ9D3V8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227aQ9D3V8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms