Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Stag1Q9D3E6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag1Q9D3E6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag1Q9D3E6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag1Q9D3E6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stag1Q9D3E6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms